Water Modelling

Dalam pembuatan Water Modelling kali ini kita akan membuat simulasi dari penggambaran sebenarnya dari sebuah air yang jatuh dari ketinggian tertentu ke dalam sebuah bejana atau wadah yang di buat dengan volume bejana yang telah di tentukan dan wadah tersebut akan terisi air yang jatuh tersebut sehingga wadah akan terisi penuh oleh air. Konsep yang di gunakan dalam kimia komputasi , model klasik air yang digunakan untuk simulasi cluster air , cairan air, dan larutan encer dengan pelarut eksplisit. Model ini menggunakan perkiraan dari mekanika molekul. dapat diklasifikasikan dengan jumlah poin yang digunakan untuk mendefinisikan model (atom ditambah situs dummy), Sebuah alternatif untuk model air eksplisit adalah dengan menggunakan solvasi implisit model, juga dikenal sebagai model kontinum, contoh yang akan menjadi model solsavi. Sebuah model air di definisikan oleh geometri, bersama-sama dengan parameter lain seperti biaya atom dan Lennard-Jones parameter.

Model air sederhana

1. Model air sederhana memperlakukan molekul air sebagai kaku dan hanya bergantung pada interaksi non-berikat . Interaksi elektrostatik dimodelkan menggunakan hukum coloumb dan gaya dispersi dan tolakan menggunakan potesial Lennard-jones . Potensi untuk model seperti TIP3P dan TIP4P diwakili oleh

di mana k C, kostanta elektrostatik, memiliki nilai 332.1 Å · kkal / mol dalam satuan yang umum digunakan dalam pemodelan molekul, q i adalah biaya parsial relatif terhadap muatan elektron, r ij adalah jarak antara dua atom atau situs dibebankan, dan A dan B adalah Lennard-Jones parameter. Situs dibebankan mungkin pada atom atau pada situs dummy (seperti pasangan mandiri). Dalam model air yang paling, istilah Lennard-Jones hanya berlaku untuk interaksi antara atom oksigen. Gambar di bawah menunjukkan bentuk umum dari 3 - 6 untuk model air-situs. Parameter geometrik yang tepat (jarak dan sudut OH HOH) bervariasi tergantung pada model.

2. Sebuah model tempat air yang didasarkan pada model tiga-situs asing SPC telah ditunjukkan untuk memprediksi sifat dielektrik dari air dengan menggunakan situs-renormalized teori cairan molekul

3. model memiliki situs interaksi tiga, sesuai dengan tiga atom dari molekul air. Setiap atom akan diberi muatan titik, dan atom oksigen juga mendapatkan Lennard-Jones parameter. model ini sangat populer untuk dinamika molekul simulasi karena kesederhanaan dan efisiensi komputasi. Kebanyakan model menggunakan geometri kaku yang cocok dengan geometri diketahui dari molekul air. Pengecualian adalah model SPC, yang mengasumsikan bentuk tetrahedral yang ideal (HOH sudut 109,47 °) bukan sudut diamati 104,5 °. Tabel di bawah ini daftar parameter untuk beberapa model.

	TIPS[4]	SPC[5]	TIP3P[6]	SPC/E[7]
r(OH), Å	0.9572	1.0	0.9572	1.0
HOH, deg	104.52	109.47	104.52	109.47
A × 10−3, kcal Å12/mol	580.0	629.4	582.0	629.4
B, kcal Å6/mol	525.0	625.5	595.0	625.5
q(O)	−0.80	−0.82	−0.834	−0.8476
q(H)	+0.40	+0.41	+0.417	+0.4238

Model SPC / E menambahkan koreksi polarisasi rata-rata untuk fungsi energi potensial:

di mana μ adalah dipole dari molekul air secara efektif terpolarisasi (2,35 D untuk model SPC / E), μ 0 adalah momen dipol dari molekul air yang terisolasi (1,85 D dari percobaan), dan α i adalah polarisabilitas isotropik konstan, dengan nilai 1,608 × 10 -40 F m 2. Karena biaya dalam model adalah konstan, koreksi ini hanya menghasilkan menambahkan 1,25 kkal / mol (5.22 kJ / mol) dengan energi total. Hasil Model SPC / E di kepadatan yang lebih baik dan difusi konstan dari model SPC.

Model TIP3P diimplementasikan dalam CHARMM medan kekuatan adalah sedikit versi modifikasi dari aslinya. Perbedaannya terletak pada Lennard-Jones parameter: seperti TIP3P, versi CHARMM model menempatkan Lennard-Jones parameter pada atom hidrogen juga, di samping satu di oksigen. Tuduhan tidak dimodifikasi.

Fleksibel SPC air Model 

Titik muatan fleksibel sederhana air model (atau model air Fleksibel SPC) adalah re-parametrization dari model air tiga-situs SPC. Model SPC kaku, sementara model SPC fleksibel fleksibel. Dalam model Toukan dan Rahman, OH peregangan dibuat anharmonic dan dengan demikian perilaku dinamis baik dijelaskan. Ini adalah salah satu dari tiga pusat yang paling akurat air model tanpa memperhitungkan polarisasi . Dalam dinamika molekuler simulasi memberikan yang benar kepadatan dan permitivitas dielektrik air.

4. model menempatkan muatan negatif pada atom dummy (berlabel M dalam gambar) ditempatkan dekat oksigen sepanjang bisektris dari sudut HOH. Hal ini meningkatkan distribusi elektrostatik di sekitar molekul air. Model pertama yang menggunakan pendekatan ini adalah model Bernal-Fowler diterbitkan pada tahun 1933, yang juga merupakan model air awal. Namun, model BF tidak mereproduksi dengan baik sifat sebagian besar air, seperti kerapatan dan panas penguapan , dan karena itu hanya kepentingan sejarah. Ini merupakan konsekuensi dari metode parameterization, model-model baru, yang dikembangkan setelah komputer modern menjadi tersedia, yang parameter dengan menjalankan metropolis monte carlo atau dinamika molekul simulasi dan menyesuaikan parameter sampai sifat massal yang direproduksi dengan cukup baik. Model TIP4P, pertama kali diterbitkan pada tahun 1983, secara luas diimplementasikan dalam paket perangkat lunak kimia komputasi dan sering digunakan untuk simulasi sistem biomolekuler. Ada reparameterizations berikutnya dari model TIP4P untuk keperluan tertentu: model TIP4P-Ew, untuk digunakan dengan metode penjumlahan Ewald, TIP4P/Ice, untuk simulasi air es padat, dan TIP4P/2005, sebuah parameterisasi umum untuk mensimulasikan seluruh diagram fase air terkondensasi.

	BF[12]	TIPS2[13]	TIP4P[6]	TIP4P-Ew[14]	TIP4P/Ice[15]	TIP4P/2005[16]
r(OH), Å	0.96	0.9572	0.9572	0.9572	0.9572	0.9572
HOH, deg	105.7	104.52	104.52	104.52	104.52	104.52
r(OM), Å	0.15	0.15	0.15	0.125	0.1577	0.1546
A × 10−3, kcal Å12/mol	560.4	695.0	600.0	656.1	857.9	731.3
B, kcal Å6/mol	837.0	600.0	610.0	653.5	850.5	736.0
q(M)	−0.98	−1.07	−1.04	−1.04844	−1.1794	−1.1128
q(H)	+0.49	+0.535	+0.52	+0.52422	+0.5897	+0.5564

5. model menempatkan muatan negatif pada atom dummy (berlabel L) mewakili pasangan mandiri dari atom oksigen, dengan geometri tetrahedral seperti. Sebuah model awal dari jenis adalah model BNS dari Ben-Naim dan Stillinger, diusulkan pada tahun 1971, segera digantikan oleh model ST2 dari Stillinger dan Rahman pada tahun 1974. Terutama disebabkan oleh kenaikan biaya komputasi mereka, lima-situs model tidak dikembangkan banyak sampai tahun 2000, ketika model TIP5P dari Mahoney dan Jorgensen diterbitkan. Bila dibandingkan dengan model sebelumnya, hasil model TIP5P perbaikan dalam geometri untuk dimer air , yang lebih "tetrahedral" air struktur yang baik mereproduksi percobaan fungsi distribusi radial dari difraksi neuron, dan suhu kepadatan maksimum air. Model TIP5P-E adalah reparameterization dari TIP5P untuk digunakan dengan jumlah Ewald.

	BNS[17]	ST2[17]	TIP5P[18]	TIP5P-E[19]
r(OH), Å	1.0	1.0	0.9572	0.9572
HOH, deg	109.47	109.47	104.52	104.52
r(OL), Å	1.0	0.8	0.70	0.70
LOL, deg	109.47	109.47	109.47	109.47
A × 10−3, kcal Å12/mol	77.4	238.7	544.5	554.3
B, kcal Å6/mol	153.8	268.9	590.3	628.2
q(L)	−0.19562	−0.2357	−0.241	−0.241
q(H)	+0.19562	+0.2357	+0.241	+0.241
RL, Å	2.0379	2.0160
RU, Å	3.1877	3.1287

Catatan, bagaimanapun, bahwa BNS dan ST2 model tidak menggunakan hukum Coulomb langsung untuk istilah elektrostatik, tapi versi modifikasi yang diperkecil pada jarak pendek dengan mengalikan dengan fungsi switching S (r):

Oleh karena itu L dan U R R parameter hanya berlaku untuk BNS dan ST2.

6. menggabungkan semua situs dari 4 - dan 5-situs Model ini dikembangkan oleh Nada dan van der Eerden. Awalnya dirancang untuk mempelajari air / es sistem, namun memiliki titik leleh yang sangat tinggi

Komputasi biaya

Biaya komputasi dari simulasi air meningkat dengan jumlah situs interaksi dalam model air. Waktu CPU adalah sekitar sebanding dengan jumlah jarak interatomik yang perlu dihitung. Untuk model 3-situs, 9 jarak yang diperlukan untuk setiap pasangan molekul air (setiap atom dari satu molekul terhadap setiap atom dari molekul lain, atau 3 × 3). Untuk model 4-situs, 10 jarak yang diperlukan (setiap situs dibebankan dengan setiap situs dibebankan, ditambah interaksi OO, atau 3 × 3 + 1). Untuk model 5-situs, 17 jarak yang diperlukan (4 × 4 + 1). Akhirnya, untuk model 6-situs, 26 jarak yang diperlukan (5 × 5 + 1). Bila menggunakan model air kaku dalam dinamika molekuler, ada biaya tambahan yang terkait dengan menjaga struktur dibatasi, menggunakan algoritma kendalan panjang ikatan dibatasi sering mungkin untuk meningkatkan langkah waktu).

sumber : http://en.wikipedia.org/wiki/Water_model

SOSIAL MEDIA PADA UNIVERSITAS DI INDONESIA

SOSIAL MEDIA adalah sebuah media online, dengan para penggunanya bisa dengan mudah berpartisipasi, berbagi, dan menciptakan isi meliputi blog, jejaring sosial, wiki, forum dan dunia virtual. 

   Sosial media ini diperuntukkan bagi setiap kalangan baik individu, organisasi dan sebagainya seperti halnya setiap Universitas pasti memiliki berbagai macam sosial media guna mempermudah para user (publik), mahasiswa, dosen mencari dan mendapatkan informasi berupa tulisan,gambar,video yang berkaitan dengan Universitas masing - masing. 

   Kali ini saya akan mengulas dan membandingkan sarana Sosial Media yang dimiliki oleh 2 Universitas yaitu UNIVERSITAS PAKUAN dan UNIVERSITAS HALUOLEO. Berikut tabelnya :

UNIVERSITAS PAKUAN :

• www.unpak.ac.id

id.wikipedia.org/wiki/Universitas_Pakuan

http://www.facebook.com/pages/Universitas-Pakuan-Bogor/165566783475773

https://twitter.com/Univ_Pakuan

www.linkedin.com/groups/Universitas-Pakuan-4244821

 http://www.plusg.info/index.php?type=education&query=Universitas%20Pakuan

UNIVERSITAS HALUOLEO

•  http://www.unhalu.ac.id/

id.wikipedia.org/wiki/Universitas_Haluoleo

www.facebook.com/.../Universitas-Haluoleo/93868251455

https://twitter.com/Unhalu_kendari

id.linkedin.com/pub/pplh-unhalu/b/167/173

http://www.plusg.info/index.php?type=education&query=Universitas%20Haluoleo

   Diantara kedua Universitas diatas, Sosial Media yang sama - sama dimiliki keduanya yaitu Wikipedia ( Proyek Kolaborasi ) , Facebook  ( Situs Jejaring Sosial ), Twitter ( Microblog ), Linkedin ( Social network service ).

   

    Hal ini menunjukkan bahwa Universitas Pakuan dan Universitas Haluoleo mempunyai sosial media yang sama dan sepadan. Dan banyak diantara kita bisa mengetahui sosial media apa saja yang ada pada universitas tersebut.

Amazing Cannes

            Cannes merupakan kota yang terletak di bagian selatan Perancis dan merupakan bagian dari metropolitan Nice. Kota yang dibangun memang untuk sebagai kota peristirahatan ini, merupakan salah satu tujuan utama bagi para pencinta pantai. Untuk sampai ke Cannes, bisa ditempuh melalui kereta TGV ataupun kereta. Jika memilih untuk naik kereta TGV, waktu yang ditempuh bisa mencapai hingga 8-9 jam, sedangkan jika menggunakan pesawat hanya 1,5 jam.

            Namun rasa pegal karena lamanya perjalanan, tentu akan langsung sirna begitu sampai di Cannes dan melihat pantainya yang sangat jernih ini. Dari stasiun tempat kereta transit, sudah terlihat buih-buih laut yang merona dari kejauhan, sungguh amat cantik.

            Bukan hal baru lagi jika setiap bulan April, Mei, dan Oktober kota mungil nan cantik ini ramai mendadak pada bulan-bulan tertentu selain holiday season. Hal ini dikarenakan terdapat tiga acara besar yang rutin di lakukan di Cannes yaitu: MIPTV, MIPCOM, dan Le Festival International du Film de Cannes (Cannes Film Festival).

            MIPCOM dan MIPTV merupakan acara tahunan internasional untuk pemasaran dan membeli konten hiburan. Perwakilan dari setiap stasiun televisi di seluruh dunia diundang dan diajak untuk menghadiri acara ini. Tidak heran jika hampir seluruh apartemen ludes dalam seketika :D

            Sedangkan Le Festival International du Film de Cannes merupakan acara annual yang juga sudah dirayakan sejak tahun 1940-an. Acara ini merupakan festival film yang paling ditunggu-tunggu bagi para artis Hollywood. Karena disinilah mereka dapat menikmati festival sekaligus berlibur ke kota yang paling cantik di Perancis ini.

            Selain menjadi langganan acara-acara besar, Cannes juga surga bagi para pecinta makanan! Siapapun pasti akan jatuh hati dengan pizza buatan restoran P’aravion. Pizza tipis dengan berbagai pilihan rasa topping ini sudah terkenal kemana-mana, yang uniknya ternyata juga cocok bagi lidah orang Indonesia. Disini pizza dipanggang dengan oven batu, sehingga sering menjadi atraksi unik bagi orang yang pertama kali datang kesini. Café-café kecil disekeliling P’aravion juga memiliki menu spesial mereka yang biasanya membuat kita betah berlama-lama untuk sekedar duduk dan menikmati kue dan secangkir kopi.

           

            Saat langit berubah gelap, disitulah terlihat jejeran kasino dan restoran-restoran mewah mulai ramai dikunjungi. Lampu-lampu hias di sepanjang pelabuhan juga semakin mewarnai romantisme ala Perancis. Kota Tua juga merupakan tempat paling artistic yang membuat para pasangan yang sedang dimabuk asmara terpendar oleh nuansa romantisme ini.

First time using internet

Pertama tama gw mau ngucapin kepada temen gw yang ngebuat gw bisa berkenalan dengan internet pada saat gw di ajak ke "WARNET". Dan pada saat itu gw masih awam dengan yang namanya "INTERNET" setau gw internet itu singkatan makanan (INdomie TElor koRNET) wakakaka. Dan Pertama kali gw menggunakan internet adalah pada saat gw bermain game. Game pada jaman bahela itu masih bayar cooooy. gk kaya sekarang yang ngasih user buat bermain (FREE). Dulu ada yang nama nya "VOUCER GAME", dari range harga yang berbagai macam. Misalkan 25rb gw beli itu voucher, dan gw cuma bisa maen game hanya 5 jam. jadi 1 jam = 5rb. Belom untuk bayar warnet nya. Aje gile bener kaga tu? .
Dan yang pertama kali gw buka web atau browsing adalah "OM GUGEL" tanya kenapa?
karena di setiap warnet telah di set,pas setiap kita buka browser yang pertama akan mucul adalah "GOOGLE" . Dulu masih jaman2 nya maen chat, ex : YM, WML, MRC, dll.

New Media (Playstation 4)

Playstation 4 (PS 4) menjadi pilihan yang dicari anak muda di tahun 2012. Menawarkan konsep ramah lingkungan, PS 4 menyajikan fitur automatic switch off yang memungkinkan gadget tersebut untuk mati secara otomatis apabila tidak digunakan selama 30 menit. Tak hanya itu, dukungan terhadap tampilan high definition dan desain yang sangnat menarik (futuristik). Dan isu keluar nya  Playstation 4 ini pada akhir tahun 2012.

Bagi2 Link game EMULATOR

Ass.wr.wb
saya akan membagikan Link emulator.
apa itu emulator? Emulator atau lebih tepatnya piranti lunak emulator memungkinkan suatu program atau piranti lunak yang dibuat pada awalnya oleh suatu sistem komputer (arsitektur dan sistem operasi) dan untuk dijalankan dalam sistem itu (atau dijalankan dalam suatu sistem yang didedikasikan), dapat dijalankan dalam sistem komputer yang sama sekali berbeda. Sebagai contoh suatu programWindows dapat dijalankan di sistem operasi Linux dengan menggunakan piranti lunak emulator Wine. Ada pula program yang mengemulasikan suatu komputer dalam komputer, misalnyaVMware. Contoh lain adalah program-program emulator untuk menjalankan permainan komputer yang awalnya hanya bisa dijalankan pada konsolnya masing-masing, misalnya Nintendo, Atari,PlayStation, XBox dan lain-lain.

dah gk usah banyak cocot lagi, langsung sedot aja ya.
klik disini

Thank you for visiting